Primer genoma de referencia a nivel cromosómico del Cóndor Andino (Vultur gryphus)

Los recursos genómicos de alta calidad son cruciales para la conservación biológica del siglo 21, proporcionando datos esenciales para mejorar la diversidad genética en programas de conservación in situ y ex situ. En este trabajo presentamos el primer ensamblaje del genoma del Cóndor Andino (Vultur gryphus) a nivel cromosómico. Esta especie ha sufrido extinciones locales y disminuciones poblacionales en Sudamérica, lo que ha reducido su variación genética natural. Para apoyar su conservación, utilizamos un enfoque híbrido de secuenciación con lecturas cortas (WGS-Illumina) y largas (WGS-ONT) junto con la captura de la conformación estructural cromosómica (Hi-C). Este método permitió obtener un genoma de referencia con una integridad del 97,5 % basado en ortólogos de copia única, indicando la alta precisión y completitud del ensamblado. Obtuvimos 1,2 Gb distribuidos en ca. 40 cromosomas: un par de cromosomas sexuales, 10 autosomas y > 30 microcromosomas. El análisis de sintenia entre el Cóndor Andino y el Cóndor Californiano (Gymnogyps californianus) reveló una alta colinealidad, indicando una gran similitud en la organización y secuencia de los genes, destacando su cercanía evolutiva. Además, los análisis comparativos mostraron que, aunque el Cóndor Andino posee menor heterocigosidad genómica total, tiene menos regiones contiguas homocigotas que el Cóndor Californiano, sugiriendo que este último, aunque ha pasado por un severo cuello de botella reciente, aún posee mayor variación genómica total. En conjunto, estos datos proporcionan una herramienta poderosa para desarrollar estrategias de conservación más efectivas, como esquemas de cría en cautiverio inteligentes y la identificación de posibles unidades evolutivas de la especie.